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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
31/08/2021 |
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Data da última atualização: |
31/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TREVISOLI, P. A.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; PETRINI, J.; MARGARIDO, G. R. A.; LEDUR, M. C.; MOURÃO, G. B.; GARRICK, D.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
PRISCILA ANCHIETA TREVISOLI, ESALQ; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; ALINE SILVA MELLO CESAR, ESALQ; JULIANA PETRINI, ESALQ; GABRIEL RODRIGUES ALVES MARGARIDO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; GERSON BARRETO MOURÃO, ESALQ; DORIAN GARRICK, Massey University; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
A missense mutation in the MYBPH gene is associated with abdominal fat traits in meat-type chickens. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 12, n. 698163, 2021. |
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DOI: |
10.3389/fgene.2021.698163 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Chicken is an important source of protein for human nutrition and a model system for growth and developmental biology. Although the genetic architecture of quantitative traits in meat-type chickens has been the subject of ongoing investigation, the identification of mutations associated with carcass traits of economic interest remains challenging. Therefore, our aim was to identify predicted deleterious mutation, which potentially affects protein function, and test if they were associated with carcass traits in chickens. For that, we performed a genome-wide association analysis (GWAS) for breast, thigh and drumstick traits in meat-type chickens and detected 19 unique quantitative trait loci (QTL). We then used: (1) the identified windows; (2) QTL for abdominal fat detected in a previous study with the same population and (3) previously obtained whole genome sequence data, to identify 18 predicted deleterious single nucleotide polymorphisms (SNPs) in those QTL for further association with breast, thigh, drumstick and abdominal fat traits. Using the additive model, a predicted deleterious SNP c.482C > T (SIFT score of 0.4) was associated (p-value < 0.05) with abdominal fat weight and percentage. This SNP is in the second exon of the MYBPH gene, and its allele frequency deviates from Hardy?Weinberg equilibrium. In conclusion, our study provides evidence that the c.482C > T SNP in the MYBPH gene is a putative causal mutation for fat deposition in meat-type chickens. |
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Palavras-Chave: |
Gordura abdominal; Meat-type; MYBPH; Predicted deleterious SNPs. |
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Thesagro: |
Carne; Frango de Corte; Genética Animal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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005 2021-08-31
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520 $aAbstract: Chicken is an important source of protein for human nutrition and a model system for growth and developmental biology. Although the genetic architecture of quantitative traits in meat-type chickens has been the subject of ongoing investigation, the identification of mutations associated with carcass traits of economic interest remains challenging. Therefore, our aim was to identify predicted deleterious mutation, which potentially affects protein function, and test if they were associated with carcass traits in chickens. For that, we performed a genome-wide association analysis (GWAS) for breast, thigh and drumstick traits in meat-type chickens and detected 19 unique quantitative trait loci (QTL). We then used: (1) the identified windows; (2) QTL for abdominal fat detected in a previous study with the same population and (3) previously obtained whole genome sequence data, to identify 18 predicted deleterious single nucleotide polymorphisms (SNPs) in those QTL for further association with breast, thigh, drumstick and abdominal fat traits. Using the additive model, a predicted deleterious SNP c.482C > T (SIFT score of 0.4) was associated (p-value < 0.05) with abdominal fat weight and percentage. This SNP is in the second exon of the MYBPH gene, and its allele frequency deviates from Hardy?Weinberg equilibrium. In conclusion, our study provides evidence that the c.482C > T SNP in the MYBPH gene is a putative causal mutation for fat deposition in meat-type chickens.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 5 | |
| 1. |  | AMARAL JÚNIOR, J. M.; BRCKO, C. C.; LOURENÇO JÚNIOR, J. de B.; MARTORANO, L. G.; NAHUM, B. de S.; RÊGO, A. C. do; SILVA, A. G. M. e. Desempenho de fêmeas bubalinas suplementadas com torta de palmiste e criadas em regime de pastejo rotacionado no período seco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 24., 2014, Vitória. A zootecnia fazendo o Brasil crescer: anais... Vitória: Universidade Federal do Espírito Santo, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|    |
| 2. | | AMARAL JUNIOR, J. M. do; BRCKO, C. C.; MORAIS, E. de; MARTORANO, L. G.; NAHUM, B. de S.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; RÊGO, A. C. do; SILVA, A. G. M. e. Desempenho de fêmeas bubalinas suplementadas com torta de palmiste mantidas em sistema de lotação intermitente. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 24., 2014, Vitória. A zootecnia fazendo o Brasil crescer: anais... Vitória: Universidade Federal do Espírito Santo, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | BRCKO, C. C.; ARAÚJO, C. V. de; ARAÚJO, S. I.; RENNÓ, F. P.; MARCONDES, C. R. Estimação de parâmetros genéticos da produção leiteira e idade ao primeiro parto de vacas Pardo-Suíças por meio de inferência bayesiana. Revista de Ciências Agrárias, Belém, PA, v. 53, n. 1, p. 59-63, jan./jun. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | BRCKO, C. C.; SILVA, J. A. R. DA; GARCIA, A. R.; SILVA, A. G. M. E; MARTORANO, L. G.; VILELA, R. A.; NAHÚM, B. DE S.; BARBOSA, A. V. C.; SILVA, W. C. DA; RODRIGUES, T. C. G. DE C.; SILVA, E. B. R. DA; LOURENÇO JÚNIOR, J. DE B. Effects of climatic conditions and supplementation with palm cake on the thermoregulation of crossbred buffaloes raised in a rotational grazing system and with natural shade in humid tropical regions. Animals, v. 14, n. 53, 2024. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 5. | | BRCKO, C. C.; SILVA, J. A. R. da; MARTORANO, L. G.; VILELA, R. A.; NAHUM, B. de S.; SILVA, A. G. M.; BARBOSA, A. V. C.; BEZERRA, A. S.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B. Infrared thermography to assess thermoregulatory reactions of female buffaloes in a humid tropical environment. Frontiers in Veterinary Science, v. 7, Article 180, May 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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